Его обвиняют в незаконной постановке земельных участков в Ростове-на-Дону на кадастровый учет, содействии льготной приватизации, а также отчуждению земли из состава муниципальной собственности, рыночной стоимостью 30 млн 560 тыс руб. По версии следствия, Алексей Полянский, игнорируя факт нахождения земельных участков в зоне природных ландшафтов, 23 декабря 2010 года, вынес незаконное распоряжение, разрешающее использовать для садоводства 22 земельных участка общей площадью 1,65 га, находящихся в муниципальной собственности. Совершённые главным архитектором умышленные действия повлекли за собой существенное нарушение охраняемых законом интересов государства, а именно: лишили права построить на них многоэтажные жилые дома, изначально предусмотренные генеральным планом развития города. Расследование уголовного дела продолжается.